In the table below you can see the SeRenDIP-CE Conformational Epitope prediction example P0DTC9 — Name: SARS-CoV-2 Nucleoprotein — UniProtKB: NCAP_SARS2
. The table
contains sequence position, prediction scores and classification based on the default cut-off of 0.5 (above is predicted interaction).
Qingzhen Hou1, Reza Haydarlou, Bas Stringer, Katharina Waury, Henriette Capel, Sanne Abeln, Jaap Heringa, K. Anton Feenstra
SeRenDIP-CE: Sequence-based Interface Prediction for Conformational Epitopes
Bioinformatics advance 11 May 2021, doi: 10.1093/bioinformatics/btab3211Department of Biostatistics, School of Public Health &
National institute of health data science of China; Shandong 250002, P. R. China
Qingzhen Hou1, Paul De Geest, Christian Griffioen, Sanne Abeln,
Jaap Heringa, K. Anton Feenstra.
SeRenDIP: remastered alignment profiles for fast
and accurate predictions of PPI interface positions.Bioinformatics 35, pp 4794–4796, 2019, doi: 10.1093/bioinformatics/btz428 13BIO-BioInfo – BioModeling, BioInformatics & BioProcesses, Université Libre de Bruxelles
Qingzhen Hou, Paul De Geest, Wim F. Vranken, Jaap Heringa and K. Anton Feenstra Seeing the Trees through the Forest:
Sequence-based Homo- and Heteromeric
Protein-protein Interaction sites prediction using
Random Forest. Bioinformatics, 2017, doi: 10.1093/bioinformatics/btx005
Color better than threshold:
Sequence
Models
Epitope Prediction
Pos
AA
Model 1
Model 2
Model 3
Model 4
Model 5
Average
Pred
Std. Dev.
Z-score
x of 411 rows match filter(s)
5
G
0.468
0.480
0.532
0.518
0.518
0.503
I
0.0276
0.0195
6
P
0.520
0.482
0.544
0.516
0.512
0.515
I
0.0222
0.1524
7
Q
0.546
0.492
0.522
0.506
0.546
0.522
I
0.0240
0.2394
8
N
0.552
0.490
0.490
0.526
0.516
0.515
I
0.0262
0.1524
9
Q
0.568
0.482
0.544
0.482
0.544
0.524
I
0.0396
0.2578
10
R
0.554
0.466
0.506
0.536
0.544
0.521
I
0.0357
0.2257
11
N
0.566
0.492
0.492
0.540
0.558
0.530
I
0.0356
0.3219
12
A
0.548
0.456
0.466
0.572
0.544
0.517
I
0.0525
0.1799
13
P
0.562
0.500
0.538
0.606
0.572
0.556
I
0.0395
0.6198
14
R
0.548
0.508
0.492
0.602
0.476
0.525
I
0.0506
0.2715
15
I
0.478
0.478
0.492
0.530
0.480
0.492
NI
0.0222
-0.1134
16
T
0.588
0.534
0.482
0.564
0.420
0.518
I
0.0674
0.1845
17
F
0.506
0.464
0.496
0.566
0.474
0.501
I
0.0399
-0.0034
18
G
0.564
0.550
0.516
0.594
0.464
0.538
I
0.0498
0.4136
19
G
0.546
0.516
0.464
0.560
0.510
0.519
I
0.0372
0.2028
20
P
0.568
0.520
0.486
0.600
0.484
0.532
I
0.0512
0.3449
21
S
0.560
0.498
0.502
0.518
0.472
0.510
I
0.0325
0.0974
22
D
0.650
0.504
0.544
0.558
0.484
0.548
I
0.0643
0.5328
23
S
0.674
0.538
0.576
0.552
0.500
0.568
I
0.0653
0.7619
24
T
0.638
0.486
0.534
0.566
0.492
0.543
I
0.0622
0.4778
25
G
0.606
0.500
0.510
0.538
0.474
0.526
I
0.0504
0.2761
26
S
0.584
0.448
0.570
0.506
0.480
0.518
I
0.0582
0.1845
27
N
0.620
0.468
0.578
0.536
0.442
0.529
I
0.0742
0.3128
28
Q
0.614
0.506
0.538
0.516
0.480
0.531
I
0.0510
0.3357
29
N
0.624
0.528
0.512
0.536
0.454
0.531
I
0.0612
0.3357
30
G
0.654
0.478
0.524
0.578
0.522
0.551
I
0.0675
0.5694
31
E
0.632
0.450
0.554
0.540
0.524
0.540
I
0.0652
0.4411
32
R
0.608
0.464
0.544
0.506
0.452
0.515
I
0.0635
0.1524
33
S
0.596
0.484
0.514
0.510
0.444
0.510
I
0.0558
0.0928
34
G
0.586
0.500
0.474
0.534
0.492
0.517
I
0.0442
0.1799
35
A
0.630
0.444
0.528
0.506
0.478
0.517
I
0.0705
0.1799
36
R
0.604
0.466
0.506
0.520
0.494
0.518
I
0.0520
0.1890
37
S
0.550
0.476
0.494
0.538
0.478
0.507
I
0.0346
0.0653
38
K
0.600
0.522
0.504
0.538
0.468
0.526
I
0.0487
0.2853
39
Q
0.584
0.512
0.532
0.534
0.470
0.526
I
0.0412
0.2853
40
R
0.600
0.484
0.546
0.572
0.500
0.540
I
0.0485
0.4457
41
R
0.566
0.466
0.508
0.526
0.508
0.515
I
0.0361
0.1524
42
P
0.586
0.412
0.478
0.530
0.474
0.496
NI
0.0654
-0.0630
43
Q
0.632
0.458
0.528
0.546
0.480
0.529
I
0.0677
0.3128
44
G
0.598
0.458
0.516
0.534
0.502
0.522
I
0.0511
0.2303
45
L
0.602
0.470
0.494
0.590
0.522
0.536
I
0.0583
0.3907
46
P
0.654
0.472
0.512
0.556
0.498
0.538
I
0.0714
0.4228
47
N
0.620
0.598
0.572
0.582
0.540
0.582
I
0.0298
0.9269
48
N
0.592
0.570
0.588
0.524
0.524
0.560
I
0.0335
0.6657
49
T
0.524
0.480
0.528
0.456
0.450
0.488
NI
0.0368
-0.1593
50
A
0.420
0.372
0.398
0.336
0.374
0.380
NI
0.0315
-1.3921
51
S
0.354
0.390
0.370
0.320
0.298
0.346
NI
0.0373
-1.7770
52
W
0.254
0.268
0.280
0.306
0.262
0.274
NI
0.0202
-2.6065
53
F
0.220
0.214
0.236
0.306
0.252
0.246
NI
0.0369
-2.9319
54
T
0.376
0.426
0.374
0.432
0.352
0.392
NI
0.0351
-1.2546
55
A
0.340
0.354
0.382
0.398
0.300
0.355
NI
0.0382
-1.6808
56
L
0.386
0.398
0.376
0.364
0.376
0.380
NI
0.0127
-1.3921
57
T
0.494
0.512
0.530
0.518
0.500
0.511
I
0.0143
0.1065
58
Q
0.586
0.608
0.584
0.562
0.534
0.575
I
0.0280
0.8398
59
H
0.552
0.536
0.570
0.516
0.570
0.549
I
0.0232
0.5419
60
G
0.562
0.496
0.508
0.534
0.604
0.541
I
0.0435
0.4503
61
K
0.660
0.532
0.622
0.580
0.664
0.612
I
0.0560
1.2614
62
E
0.634
0.536
0.596
0.564
0.620
0.590
I
0.0402
1.0140
63
D
0.586
0.514
0.576
0.558
0.604
0.568
I
0.0343
0.7573
64
L
0.572
0.460
0.508
0.534
0.506
0.516
I
0.0411
0.1661
65
K
0.636
0.608
0.566
0.532
0.592
0.587
I
0.0398
0.9773
66
F
0.534
0.440
0.504
0.460
0.496
0.487
NI
0.0371
-0.1684
67
P
0.484
0.468
0.518
0.460
0.528
0.492
NI
0.0301
-0.1134
68
R
0.628
0.536
0.620
0.518
0.566
0.574
I
0.0492
0.8261
69
G
0.564
0.474
0.576
0.538
0.522
0.535
I
0.0401
0.3815
70
Q
0.578
0.540
0.530
0.544
0.570
0.552
I
0.0206
0.5832
71
G
0.466
0.432
0.464
0.456
0.428
0.449
NI
0.0180
-0.5992
72
V
0.498
0.464
0.474
0.428
0.476
0.468
NI
0.0256
-0.3838
73
P
0.572
0.438
0.464
0.436
0.460
0.474
NI
0.0562
-0.3151
74
I
0.600
0.510
0.550
0.552
0.516
0.546
I
0.0359
0.5053
75
N
0.582
0.534
0.572
0.574
0.520
0.556
I
0.0275
0.6290
76
T
0.622
0.570
0.580
0.584
0.584
0.588
I
0.0198
0.9910
77
N
0.620
0.546
0.612
0.562
0.574
0.583
I
0.0320
0.9315
78
S
0.596
0.508
0.506
0.544
0.494
0.530
I
0.0416
0.3219
79
S
0.658
0.608
0.588
0.598
0.582
0.607
I
0.0303
1.2064
80
P
0.678
0.590
0.528
0.602
0.538
0.587
I
0.0600
0.9819
81
D
0.646
0.560
0.550
0.560
0.568
0.577
I
0.0392
0.8627
82
D
0.658
0.578
0.524
0.592
0.572
0.585
I
0.0483
0.9544
83
Q
0.612
0.554
0.568
0.556
0.492
0.556
I
0.0430
0.6290
84
I
0.524
0.540
0.538
0.488
0.462
0.510
I
0.0342
0.1020
85
G
0.432
0.462
0.472
0.380
0.376
0.424
NI
0.0449
-0.8834
86
Y
0.528
0.584
0.474
0.476
0.454
0.503
I
0.0528
0.0195
87
Y
0.412
0.404
0.398
0.428
0.418
0.412
NI
0.0117
-1.0254
88
R
0.602
0.588
0.502
0.538
0.456
0.537
I
0.0604
0.4090
89
R
0.576
0.624
0.522
0.534
0.542
0.560
I
0.0412
0.6657
90
A
0.578
0.548
0.526
0.530
0.516
0.540
I
0.0244
0.4365
91
T
0.598
0.576
0.496
0.532
0.484
0.537
I
0.0494
0.4090
92
R
0.568
0.594
0.550
0.548
0.490
0.550
I
0.0383
0.5557
93
R
0.544
0.526
0.520
0.520
0.496
0.521
I
0.0172
0.2257
94
I
0.578
0.492
0.530
0.476
0.448
0.505
I
0.0505
0.0378
95
R
0.548
0.572
0.580
0.564
0.558
0.564
I
0.0124
0.7207
96
G
0.610
0.546
0.536
0.558
0.522
0.554
I
0.0338
0.6061
97
G
0.614
0.582
0.572
0.582
0.538
0.578
I
0.0272
0.8719
98
D
0.604
0.552
0.614
0.562
0.604
0.587
I
0.0281
0.9819
99
G
0.564
0.514
0.562
0.536
0.522
0.540
I
0.0228
0.4365
100
K
0.602
0.568
0.592
0.580
0.628
0.594
I
0.0229
1.0598
101
M
0.542
0.524
0.562
0.538
0.508
0.535
I
0.0202
0.3815
102
K
0.558
0.536
0.608
0.562
0.566
0.566
I
0.0262
0.7390
103
D
0.556
0.562
0.520
0.514
0.586
0.548
I
0.0302
0.5282
104
L
0.494
0.494
0.478
0.476
0.484
0.485
NI
0.0086
-0.1868
105
S
0.424
0.510
0.480
0.486
0.480
0.476
NI
0.0316
-0.2922
106
P
0.450
0.552
0.456
0.524
0.424
0.481
NI
0.0541
-0.2326
107
R
0.408
0.456
0.428
0.446
0.448
0.437
NI
0.0193
-0.7367
108
W
0.314
0.238
0.292
0.292
0.310
0.289
NI
0.0304
-2.4324
109
Y
0.240
0.242
0.278
0.228
0.294
0.256
NI
0.0281
-2.8082
110
F
0.282
0.220
0.260
0.246
0.306
0.263
NI
0.0330
-2.7348
111
Y
0.224
0.222
0.208
0.180
0.272
0.221
NI
0.0334
-3.2115
112
Y
0.206
0.210
0.274
0.182
0.250
0.224
NI
0.0369
-3.1748
113
L
0.218
0.284
0.294
0.272
0.276
0.269
NI
0.0296
-2.6661
114
G
0.316
0.334
0.338
0.316
0.298
0.320
NI
0.0161
-2.0749
115
T
0.376
0.404
0.352
0.414
0.346
0.378
NI
0.0303
-1.4104
116
G
0.428
0.446
0.422
0.344
0.416
0.411
NI
0.0392
-1.0346
117
P
0.498
0.550
0.500
0.488
0.528
0.513
I
0.0256
0.1295
118
E
0.558
0.558
0.550
0.540
0.562
0.554
I
0.0088
0.5969
119
A
0.504
0.586
0.584
0.534
0.536
0.549
I
0.0354
0.5419
120
G
0.510
0.560
0.462
0.474
0.586
0.518
I
0.0537
0.1936
121
L
0.514
0.442
0.490
0.538
0.518
0.500
I
0.0368
-0.0126
122
P
0.592
0.584
0.602
0.496
0.630
0.581
I
0.0505
0.9085
123
Y
0.574
0.560
0.528
0.524
0.574
0.552
I
0.0245
0.5786
124
G
0.542
0.596
0.574
0.622
0.584
0.584
I
0.0294
0.9406
125
A
0.632
0.580
0.628
0.620
0.566
0.605
I
0.0301
1.1881
126
N
0.624
0.548
0.522
0.570
0.604
0.574
I
0.0412
0.8261
127
K
0.524
0.482
0.506
0.522
0.514
0.510
I
0.0170
0.0928
128
D
0.506
0.490
0.406
0.498
0.506
0.481
NI
0.0426
-0.2326
129
G
0.398
0.402
0.386
0.402
0.418
0.401
NI
0.0115
-1.1492
130
I
0.286
0.236
0.338
0.294
0.330
0.297
NI
0.0407
-2.3453
131
I
0.234
0.296
0.274
0.294
0.282
0.276
NI
0.0251
-2.5836
132
W
0.290
0.330
0.310
0.282
0.308
0.304
NI
0.0188
-2.2628
133
V
0.238
0.238
0.276
0.246
0.298
0.259
NI
0.0267
-2.7761
134
A
0.358
0.298
0.338
0.342
0.298
0.327
NI
0.0273
-2.0016
135
T
0.540
0.526
0.542
0.502
0.508
0.524
I
0.0182
0.2532
136
E
0.556
0.558
0.590
0.544
0.540
0.558
I
0.0197
0.6427
137
G
0.484
0.516
0.496
0.490
0.490
0.495
NI
0.0124
-0.0722
138
A
0.514
0.494
0.474
0.492
0.424
0.480
NI
0.0342
-0.2509
139
L
0.656
0.606
0.566
0.552
0.552
0.586
I
0.0448
0.9727
140
N
0.574
0.550
0.586
0.572
0.560
0.568
I
0.0138
0.7665
141
T
0.638
0.654
0.646
0.626
0.620
0.637
I
0.0140
1.5502
142
P
0.652
0.530
0.630
0.588
0.622
0.604
I
0.0475
1.1789
143
K
0.616
0.554
0.626
0.596
0.610
0.600
I
0.0281
1.1331
144
D
0.626
0.612
0.662
0.632
0.554
0.617
I
0.0398
1.3256
145
H
0.612
0.586
0.614
0.582
0.536
0.586
I
0.0315
0.9681
146
I
0.520
0.492
0.550
0.484
0.518
0.513
I
0.0261
0.1295
147
G
0.510
0.464
0.442
0.430
0.430
0.455
NI
0.0336
-0.5305
148
T
0.568
0.516
0.562
0.556
0.552
0.551
I
0.0204
0.5648
149
R
0.546
0.508
0.596
0.502
0.570
0.544
I
0.0401
0.4915
150
N
0.558
0.524
0.594
0.534
0.534
0.549
I
0.0282
0.5419
151
P
0.578
0.546
0.632
0.596
0.590
0.588
I
0.0311
0.9956
152
A
0.642
0.586
0.698
0.602
0.666
0.639
I
0.0458
1.5731
153
N
0.622
0.584
0.668
0.670
0.632
0.635
I
0.0357
1.5318
154
N
0.668
0.624
0.576
0.592
0.680
0.628
I
0.0456
1.4493
155
A
0.588
0.584
0.540
0.572
0.602
0.577
I
0.0234
0.8673
156
A
0.546
0.524
0.518
0.552
0.556
0.539
I
0.0171
0.4319
157
I
0.470
0.504
0.456
0.456
0.440
0.465
NI
0.0241
-0.4159
158
V
0.514
0.488
0.468
0.480
0.432
0.476
NI
0.0300
-0.2876
159
L
0.492
0.488
0.510
0.510
0.388
0.478
NI
0.0511
-0.2738
160
Q
0.554
0.496
0.560
0.494
0.478
0.516
I
0.0378
0.1707
161
L
0.504
0.432
0.448
0.436
0.420
0.448
NI
0.0329
-0.6130
162
P
0.506
0.542
0.540
0.580
0.580
0.550
I
0.0312
0.5511
163
Q
0.598
0.508
0.564
0.540
0.572
0.556
I
0.0341
0.6290
164
G
0.600
0.470
0.588
0.534
0.546
0.548
I
0.0514
0.5282
165
T
0.608
0.498
0.526
0.558
0.610
0.560
I
0.0495
0.6702
166
T
0.592
0.480
0.548
0.566
0.572
0.552
I
0.0430
0.5740
167
L
0.588
0.496
0.560
0.538
0.494
0.535
I
0.0408
0.3861
168
P
0.530
0.448
0.568
0.580
0.462
0.518
I
0.0603
0.1845
169
K
0.564
0.558
0.552
0.580
0.604
0.572
I
0.0209
0.8031
170
G
0.584
0.470
0.464
0.528
0.566
0.522
I
0.0545
0.2394
171
F
0.410
0.440
0.426
0.446
0.446
0.434
NI
0.0155
-0.7780
172
Y
0.572
0.520
0.438
0.482
0.486
0.500
NI
0.0499
-0.0218
173
A
0.482
0.440
0.430
0.494
0.430
0.455
NI
0.0305
-0.5305
174
E
0.590
0.514
0.514
0.544
0.476
0.528
I
0.0424
0.2990
175
G
0.604
0.564
0.520
0.548
0.538
0.555
I
0.0318
0.6107
176
S
0.608
0.544
0.536
0.576
0.496
0.552
I
0.0423
0.5786
177
R
0.588
0.576
0.490
0.600
0.502
0.551
I
0.0513
0.5694
178
G
0.676
0.552
0.512
0.630
0.494
0.573
I
0.0779
0.8169
179
G
0.626
0.484
0.544
0.596
0.446
0.539
I
0.0750
0.4319
180
S
0.642
0.486
0.518
0.532
0.474
0.530
I
0.0666
0.3311
181
Q
0.648
0.538
0.542
0.572
0.450
0.550
I
0.0712
0.5557
182
A
0.612
0.520
0.534
0.562
0.490
0.544
I
0.0462
0.4823
183
S
0.634
0.554
0.524
0.568
0.486
0.553
I
0.0550
0.5923
184
S
0.650
0.514
0.536
0.558
0.480
0.548
I
0.0641
0.5282
185
R
0.614
0.522
0.524
0.602
0.450
0.542
I
0.0670
0.4686
186
S
0.644
0.522
0.514
0.532
0.450
0.532
I
0.0702
0.3540
187
S
0.602
0.478
0.540
0.564
0.488
0.534
I
0.0520
0.3769
188
S
0.590
0.514
0.520
0.540
0.510
0.535
I
0.0329
0.3815
189
R
0.600
0.484
0.524
0.522
0.440
0.514
I
0.0590
0.1432
190
S
0.574
0.468
0.494
0.518
0.440
0.499
NI
0.0511
-0.0309
191
R
0.588
0.514
0.528
0.568
0.492
0.538
I
0.0393
0.4182
192
N
0.600
0.498
0.524
0.556
0.482
0.532
I
0.0472
0.3494
193
S
0.568
0.512
0.528
0.548
0.496
0.530
I
0.0285
0.3311
194
S
0.570
0.452
0.528
0.534
0.494
0.516
I
0.0446
0.1615
195
R
0.620
0.492
0.556
0.504
0.496
0.534
I
0.0547
0.3678
196
N
0.596
0.454
0.570
0.468
0.448
0.507
I
0.0702
0.0653
197
S
0.602
0.500
0.530
0.476
0.482
0.518
I
0.0514
0.1890
198
T
0.604
0.488
0.552
0.518
0.494
0.531
I
0.0478
0.3403
199
P
0.588
0.498
0.520
0.560
0.494
0.532
I
0.0408
0.3494
200
G
0.656
0.526
0.536
0.554
0.474
0.549
I
0.0667
0.5465
201
S
0.586
0.524
0.560
0.556
0.512
0.548
I
0.0297
0.5282
202
S
0.646
0.532
0.540
0.560
0.524
0.560
I
0.0497
0.6748
203
R
0.628
0.548
0.588
0.614
0.480
0.572
I
0.0596
0.8031
204
G
0.644
0.502
0.564
0.556
0.500
0.553
I
0.0588
0.5923
205
T
0.652
0.460
0.560
0.576
0.478
0.545
I
0.0780
0.5007
206
S
0.648
0.446
0.504
0.532
0.462
0.518
I
0.0800
0.1936
207
P
0.646
0.504
0.540
0.558
0.456
0.541
I
0.0705
0.4503
208
A
0.620
0.466
0.510
0.508
0.480
0.517
I
0.0606
0.1753
209
R
0.588
0.480
0.518
0.526
0.466
0.516
I
0.0477
0.1615
210
M
0.618
0.444
0.530
0.520
0.476
0.518
I
0.0659
0.1845
211
A
0.620
0.472
0.498
0.546
0.480
0.523
I
0.0613
0.2486
212
G
0.642
0.512
0.578
0.568
0.518
0.564
I
0.0527
0.7115
213
N
0.630
0.550
0.554
0.568
0.498
0.560
I
0.0473
0.6702
214
G
0.556
0.548
0.510
0.564
0.492
0.534
I
0.0313
0.3724
215
G
0.560
0.528
0.510
0.550
0.472
0.524
I
0.0350
0.2578
216
D
0.560
0.534
0.486
0.554
0.500
0.527
I
0.0327
0.2899
217
A
0.528
0.478
0.488
0.512
0.476
0.496
NI
0.0227
-0.0584
218
A
0.482
0.428
0.396
0.508
0.410
0.445
NI
0.0481
-0.6496
219
L
0.472
0.444
0.452
0.484
0.414
0.453
NI
0.0270
-0.5534
220
A
0.464
0.424
0.468
0.474
0.422
0.450
NI
0.0253
-0.5855
221
L
0.474
0.440
0.466
0.484
0.460
0.465
NI
0.0165
-0.4205
222
L
0.354
0.390
0.370
0.430
0.418
0.392
NI
0.0318
-1.2500
223
L
0.402
0.408
0.390
0.414
0.402
0.403
NI
0.0089
-1.1263
224
L
0.472
0.396
0.454
0.438
0.408
0.434
NI
0.0315
-0.7780
225
D
0.480
0.392
0.442
0.528
0.446
0.458
NI
0.0503
-0.5030
226
R
0.476
0.394
0.406
0.508
0.428
0.442
NI
0.0482
-0.6771
227
L
0.468
0.358
0.368
0.440
0.384
0.404
NI
0.0480
-1.1217
228
N
0.486
0.402
0.426
0.426
0.406
0.429
NI
0.0336
-0.8284
229
Q
0.540
0.528
0.422
0.502
0.446
0.488
NI
0.0515
-0.1593
230
L
0.542
0.470
0.404
0.488
0.490
0.479
NI
0.0497
-0.2601
231
E
0.532
0.432
0.444
0.524
0.402
0.467
NI
0.0580
-0.3976
232
S
0.538
0.456
0.480
0.492
0.430
0.479
NI
0.0406
-0.2555
233
K
0.634
0.476
0.468
0.536
0.524
0.528
I
0.0664
0.2990
234
M
0.632
0.488
0.510
0.556
0.522
0.542
I
0.0562
0.4594
235
S
0.634
0.492
0.498
0.552
0.464
0.528
I
0.0673
0.3036
236
G
0.630
0.444
0.512
0.560
0.502
0.530
I
0.0696
0.3219
237
K
0.660
0.452
0.542
0.584
0.492
0.546
I
0.0809
0.5098
238
G
0.604
0.446
0.526
0.540
0.484
0.520
I
0.0597
0.2120
239
Q
0.670
0.490
0.530
0.578
0.534
0.560
I
0.0687
0.6748
240
Q
0.674
0.516
0.542
0.550
0.538
0.564
I
0.0628
0.7161
241
Q
0.620
0.504
0.522
0.624
0.516
0.557
I
0.0595
0.6382
242
Q
0.662
0.530
0.540
0.614
0.522
0.574
I
0.0615
0.8261
243
G
0.644
0.512
0.510
0.592
0.506
0.553
I
0.0623
0.5877
244
Q
0.636
0.488
0.558
0.630
0.488
0.560
I
0.0725
0.6702
245
T
0.632
0.482
0.490
0.534
0.504
0.528
I
0.0612
0.3082
246
V
0.606
0.448
0.488
0.552
0.486
0.516
I
0.0627
0.1661
247
T
0.620
0.466
0.500
0.540
0.512
0.528
I
0.0581
0.2990
248
K
0.622
0.470
0.550
0.520
0.516
0.536
I
0.0561
0.3907
249
K
0.582
0.522
0.476
0.502
0.514
0.519
I
0.0392
0.2028
250
S
0.554
0.450
0.488
0.490
0.514
0.499
NI
0.0383
-0.0264
251
A
0.574
0.514
0.468
0.502
0.490
0.510
I
0.0398
0.0928
252
A
0.570
0.498
0.500
0.558
0.530
0.531
I
0.0328
0.3403
253
E
0.566
0.488
0.516
0.496
0.462
0.506
I
0.0389
0.0470
254
A
0.504
0.466
0.470
0.498
0.472
0.482
NI
0.0176
-0.2234
255
S
0.510
0.462
0.414
0.520
0.480
0.477
NI
0.0423
-0.2784
256
K
0.520
0.464
0.532
0.544
0.486
0.509
I
0.0333
0.0882
257
K
0.578
0.484
0.490
0.502
0.464
0.504
I
0.0438
0.0241
258
P
0.580
0.454
0.462
0.564
0.520
0.516
I
0.0574
0.1661
259
R
0.584
0.522
0.492
0.556
0.488
0.528
I
0.0414
0.3082
260
Q
0.606
0.500
0.498
0.496
0.454
0.511
I
0.0565
0.1065
261
K
0.652
0.556
0.558
0.538
0.532
0.567
I
0.0487
0.7527
262
R
0.572
0.496
0.554
0.486
0.532
0.528
I
0.0368
0.3036
263
T
0.564
0.498
0.564
0.506
0.522
0.531
I
0.0315
0.3357
264
A
0.574
0.510
0.542
0.480
0.418
0.505
I
0.0599
0.0378
265
T
0.616
0.568
0.640
0.584
0.548
0.591
I
0.0369
1.0277
266
K
0.642
0.564
0.648
0.606
0.602
0.612
I
0.0340
1.2706
267
A
0.584
0.552
0.658
0.604
0.648
0.609
I
0.0442
1.2339
268
Y
0.562
0.540
0.554
0.602
0.616
0.575
I
0.0326
0.8398
269
N
0.620
0.632
0.552
0.550
0.576
0.586
I
0.0382
0.9681
270
V
0.500
0.456
0.446
0.442
0.444
0.458
NI
0.0243
-0.5030
271
T
0.502
0.494
0.456
0.544
0.502
0.500
NI
0.0313
-0.0218
272
Q
0.530
0.582
0.524
0.534
0.476
0.529
I
0.0376
0.3174
273
A
0.382
0.444
0.408
0.462
0.406
0.420
NI
0.0321
-0.9292
274
F
0.462
0.478
0.386
0.396
0.394
0.423
NI
0.0433
-0.8971
275
G
0.536
0.472
0.442
0.474
0.412
0.467
NI
0.0461
-0.3930
276
R
0.566
0.598
0.572
0.558
0.532
0.565
I
0.0239
0.7298
277
R
0.522
0.522
0.604
0.506
0.524
0.536
I
0.0389
0.3907
278
G
0.546
0.542
0.558
0.530
0.544
0.544
I
0.0100
0.4869
279
P
0.656
0.516
0.656
0.638
0.622
0.618
I
0.0585
1.3302
280
E
0.720
0.548
0.660
0.680
0.642
0.650
I
0.0640
1.7014
281
Q
0.712
0.512
0.624
0.686
0.644
0.636
I
0.0772
1.5364
282
T
0.660
0.528
0.638
0.654
0.622
0.620
I
0.0537
1.3623
283
Q
0.724
0.558
0.646
0.682
0.596
0.641
I
0.0662
1.6006
284
G
0.596
0.542
0.540
0.560
0.538
0.555
I
0.0244
0.6152
285
N
0.514
0.516
0.474
0.506
0.476
0.497
NI
0.0206
-0.0493
286
F
0.538
0.482
0.506
0.506
0.458
0.498
NI
0.0299
-0.0401
287
G
0.528
0.438
0.462
0.460
0.446
0.467
NI
0.0356
-0.3976
288
D
0.544
0.472
0.538
0.518
0.444
0.503
I
0.0435
0.0195
289
Q
0.604
0.530
0.576
0.574
0.508
0.558
I
0.0387
0.6519
290
E
0.560
0.560
0.600
0.570
0.524
0.563
I
0.0272
0.7023
291
L
0.468
0.414
0.400
0.466
0.482
0.446
NI
0.0365
-0.6359
292
I
0.466
0.398
0.404
0.458
0.360
0.417
NI
0.0443
-0.9659
293
R
0.632
0.654
0.584
0.624
0.540
0.607
I
0.0451
1.2064
294
Q
0.596
0.532
0.542
0.612
0.516
0.560
I
0.0420
0.6657
295
G
0.484
0.522
0.472
0.488
0.536
0.500
I
0.0272
-0.0126
296
T
0.550
0.446
0.434
0.532
0.436
0.480
NI
0.0566
-0.2509
297
D
0.586
0.560
0.514
0.556
0.558
0.555
I
0.0259
0.6107
298
Y
0.540
0.506
0.546
0.548
0.514
0.531
I
0.0194
0.3357
299
K
0.574
0.560
0.598
0.544
0.584
0.572
I
0.0209
0.8077
300
H
0.536
0.528
0.572
0.514
0.552
0.540
I
0.0224
0.4457
301
W
0.388
0.406
0.372
0.382
0.404
0.390
NI
0.0145
-1.2729
302
P
0.380
0.370
0.360
0.382
0.360
0.370
NI
0.0105
-1.5020
303
Q
0.442
0.452
0.334
0.400
0.336
0.393
NI
0.0563
-1.2454
304
I
0.252
0.210
0.206
0.242
0.178
0.218
NI
0.0297
-3.2527
305
A
0.304
0.222
0.266
0.322
0.280
0.279
NI
0.0384
-2.5515
306
Q
0.522
0.524
0.522
0.454
0.484
0.501
I
0.0313
-0.0034
307
F
0.290
0.294
0.344
0.340
0.266
0.307
NI
0.0339
-2.2307
308
A
0.218
0.276
0.304
0.242
0.320
0.272
NI
0.0423
-2.6294
309
P
0.342
0.314
0.354
0.274
0.320
0.321
NI
0.0308
-2.0703
310
S
0.430
0.420
0.402
0.436
0.368
0.411
NI
0.0274
-1.0346
311
A
0.396
0.384
0.336
0.338
0.314
0.354
NI
0.0348
-1.6945
312
S
0.268
0.268
0.254
0.342
0.286
0.284
NI
0.0346
-2.4965
313
A
0.218
0.206
0.196
0.244
0.222
0.217
NI
0.0181
-3.2573
314
F
0.134
0.190
0.172
0.178
0.174
0.170
NI
0.0211
-3.8027
315
F
0.164
0.258
0.240
0.234
0.188
0.217
NI
0.0392
-3.2619
316
G
0.156
0.284
0.216
0.210
0.226
0.218
NI
0.0456
-3.2435
317
M
0.320
0.426
0.314
0.402
0.346
0.362
NI
0.0500
-1.6029
318
S
0.268
0.308
0.266
0.326
0.254
0.284
NI
0.0309
-2.4874
319
R
0.398
0.470
0.392
0.396
0.422
0.416
NI
0.0326
-0.9842
320
I
0.340
0.388
0.338
0.344
0.310
0.344
NI
0.0280
-1.8045
321
G
0.418
0.420
0.344
0.466
0.382
0.406
NI
0.0457
-1.0942
322
M
0.562
0.492
0.422
0.506
0.440
0.484
NI
0.0557
-0.1959
323
E
0.554
0.538
0.532
0.510
0.458
0.518
I
0.0373
0.1936
324
V
0.554
0.492
0.540
0.522
0.522
0.526
I
0.0233
0.2807
325
T
0.580
0.472
0.602
0.538
0.546
0.548
I
0.0495
0.5282
326
P
0.604
0.530
0.532
0.524
0.592
0.556
I
0.0383
0.6290
327
S
0.576
0.514
0.490
0.518
0.448
0.509
I
0.0466
0.0882
328
G
0.512
0.488
0.526
0.544
0.522
0.518
I
0.0206
0.1936
329
T
0.434
0.460
0.418
0.514
0.422
0.450
NI
0.0396
-0.5946
330
W
0.450
0.474
0.486
0.466
0.476
0.470
NI
0.0134
-0.3563
331
L
0.314
0.354
0.338
0.338
0.330
0.335
NI
0.0145
-1.9099
332
T
0.334
0.396
0.380
0.430
0.442
0.396
NI
0.0429
-1.2042
333
Y
0.164
0.248
0.234
0.250
0.288
0.237
NI
0.0454
-3.0327
334
T
0.300
0.316
0.276
0.266
0.358
0.303
NI
0.0364
-2.2720
335
G
0.194
0.266
0.196
0.236
0.274
0.233
NI
0.0376
-3.0740
336
A
0.338
0.322
0.350
0.336
0.394
0.348
NI
0.0276
-1.7587
337
I
0.274
0.356
0.232
0.310
0.344
0.303
NI
0.0510
-2.2720
338
K
0.372
0.434
0.458
0.382
0.368
0.403
NI
0.0407
-1.1308
339
L
0.398
0.404
0.384
0.402
0.402
0.398
NI
0.0081
-1.1858
340
D
0.432
0.512
0.476
0.494
0.452
0.473
NI
0.0320
-0.3242
341
D
0.472
0.556
0.574
0.518
0.506
0.525
I
0.0406
0.2715
342
K
0.550
0.586
0.586
0.544
0.582
0.570
I
0.0208
0.7802
343
D
0.546
0.542
0.540
0.522
0.568
0.544
I
0.0165
0.4823
344
P
0.560
0.548
0.548
0.550
0.568
0.555
I
0.0089
0.6107
345
N
0.578
0.578
0.522
0.492
0.532
0.540
I
0.0373
0.4457
346
F
0.466
0.494
0.512
0.534
0.470
0.495
NI
0.0286
-0.0722
347
K
0.536
0.570
0.508
0.528
0.556
0.540
I
0.0242
0.4365
348
D
0.478
0.484
0.486
0.518
0.496
0.492
NI
0.0157
-0.1043
349
Q
0.346
0.318
0.352
0.360
0.374
0.350
NI
0.0207
-1.7358
350
V
0.366
0.320
0.354
0.330
0.394
0.353
NI
0.0294
-1.7037
351
I
0.468
0.432
0.476
0.460
0.394
0.446
NI
0.0335
-0.6359
352
L
0.358
0.318
0.382
0.368
0.376
0.360
NI
0.0254
-1.6166
353
L
0.328
0.232
0.312
0.302
0.310
0.297
NI
0.0374
-2.3453
354
N
0.446
0.386
0.476
0.476
0.382
0.433
NI
0.0466
-0.7825
355
K
0.530
0.588
0.566
0.536
0.426
0.529
I
0.0623
0.3174
356
H
0.438
0.448
0.428
0.512
0.410
0.447
NI
0.0388
-0.6221
357
I
0.462
0.392
0.406
0.474
0.452
0.437
NI
0.0361
-0.7367
358
D
0.532
0.516
0.452
0.540
0.506
0.509
I
0.0346
0.0882
359
A
0.472
0.470
0.466
0.506
0.416
0.466
NI
0.0322
-0.4067
360
Y
0.492
0.484
0.504
0.518
0.456
0.491
NI
0.0233
-0.1226
361
K
0.568
0.530
0.550
0.522
0.524
0.539
I
0.0197
0.4273
362
T
0.568
0.526
0.584
0.478
0.490
0.529
I
0.0466
0.3174
363
F
0.564
0.536
0.550
0.484
0.518
0.530
I
0.0310
0.3311
364
P
0.598
0.534
0.584
0.520
0.494
0.546
I
0.0438
0.5098
365
P
0.652
0.498
0.616
0.594
0.586
0.589
I
0.0570
1.0048
366
T
0.650
0.592
0.672
0.628
0.582
0.625
I
0.0380
1.4127
367
E
0.656
0.526
0.608
0.670
0.570
0.606
I
0.0598
1.1973
368
P
0.694
0.518
0.554
0.588
0.594
0.590
I
0.0658
1.0094
369
K
0.682
0.538
0.562
0.604
0.538
0.585
I
0.0607
0.9544
370
K
0.626
0.444
0.520
0.542
0.520
0.530
I
0.0651
0.3311
371
D
0.628
0.454
0.534
0.522
0.500
0.528
I
0.0639
0.2990
372
K
0.676
0.448
0.584
0.532
0.464
0.541
I
0.0932
0.4503
373
K
0.654
0.434
0.560
0.536
0.500
0.537
I
0.0809
0.4044
374
K
0.634
0.430
0.546
0.518
0.524
0.530
I
0.0729
0.3311
375
K
0.646
0.484
0.524
0.512
0.500
0.533
I
0.0648
0.3632
376
A
0.614
0.386
0.468
0.516
0.488
0.494
NI
0.0826
-0.0814
377
D
0.618
0.466
0.524
0.532
0.544
0.537
I
0.0544
0.4044
378
E
0.610
0.432
0.478
0.540
0.492
0.510
I
0.0677
0.1020
379
T
0.616
0.470
0.468
0.538
0.538
0.526
I
0.0610
0.2807
380
Q
0.580
0.472
0.498
0.538
0.510
0.520
I
0.0413
0.2074
381
A
0.616
0.406
0.510
0.540
0.514
0.517
I
0.0753
0.1799
382
L
0.578
0.440
0.504
0.574
0.512
0.522
I
0.0570
0.2303
383
P
0.568
0.496
0.532
0.570
0.504
0.534
I
0.0346
0.3724
384
Q
0.656
0.450
0.508
0.554
0.494
0.532
I
0.0784
0.3540
385
R
0.634
0.446
0.518
0.530
0.498
0.525
I
0.0688
0.2715
386
Q
0.576
0.468
0.516
0.550
0.526
0.527
I
0.0404
0.2944
387
K
0.636
0.494
0.504
0.536
0.470
0.528
I
0.0649
0.3036
388
K
0.624
0.440
0.510
0.526
0.490
0.518
I
0.0675
0.1890
389
Q
0.590
0.420
0.504
0.584
0.514
0.522
I
0.0694
0.2394
390
Q
0.626
0.468
0.528
0.552
0.512
0.537
I
0.0583
0.4090
391
T
0.582
0.430
0.510
0.554
0.516
0.518
I
0.0575
0.1936
392
V
0.560
0.392
0.432
0.506
0.448
0.468
NI
0.0659
-0.3884
393
T
0.636
0.452
0.532
0.568
0.586
0.555
I
0.0686
0.6107
394
L
0.626
0.454
0.574
0.562
0.568
0.557
I
0.0629
0.6336
395
L
0.664
0.472
0.574
0.530
0.576
0.563
I
0.0705
0.7069
396
P
0.630
0.506
0.596
0.570
0.590
0.578
I
0.0459
0.8811
397
A
0.666
0.554
0.630
0.590
0.648
0.618
I
0.0454
1.3302
398
A
0.696
0.544
0.638
0.596
0.646
0.624
I
0.0571
1.4035
399
D
0.590
0.534
0.578
0.530
0.554
0.557
I
0.0264
0.6382
400
L
0.556
0.476
0.568
0.520
0.484
0.521
I
0.0413
0.2211
401
D
0.690
0.590
0.632
0.610
0.576
0.620
I
0.0447
1.3531
402
D
0.676
0.596
0.630
0.640
0.586
0.626
I
0.0361
1.4218
403
F
0.520
0.456
0.500
0.534
0.482
0.498
NI
0.0308
-0.0355
404
S
0.578
0.512
0.508
0.590
0.502
0.538
I
0.0424
0.4182
405
K
0.660
0.538
0.592
0.620
0.580
0.598
I
0.0455
1.1056
406
Q
0.618
0.472
0.550
0.584
0.524
0.550
I
0.0560
0.5511
407
L
0.574
0.468
0.468
0.568
0.516
0.519
I
0.0516
0.1982
408
Q
0.626
0.556
0.496
0.626
0.536
0.568
I
0.0572
0.7619
409
Q
0.628
0.576
0.552
0.568
0.560
0.577
I
0.0300
0.8627
410
S
0.544
0.550
0.492
0.552
0.472
0.522
I
0.0373
0.2349
411
M
0.534
0.478
0.468
0.548
0.508
0.507
I
0.0345
0.0653
412
S
0.520
0.460
0.484
0.534
0.498
0.499
NI
0.0292
-0.0264
413
S
0.528
0.462
0.472
0.486
0.478
0.485
NI
0.0255
-0.1868
414
A
0.562
0.466
0.470
0.496
0.478
0.494
NI
0.0395
-0.0814
415
D
0.586
0.496
0.484
0.490
0.488
0.509
I
0.0434
0.0836
(c) IBIVU 2026. If you are experiencing problems with the
site, please contact the webmaster.